MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 3315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013203	GT	3	6	1438688	1438693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_013203	CCT	2	6	1438703	1438708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_013203	ACA	2	6	1439436	1439441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_013203	CTC	2	6	1440408	1440413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_013203	TATT	2	8	1440429	1440436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_013203	TCTG	2	8	1441063	1441070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_013203	TAC	2	6	1441093	1441098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_013203	TTG	2	6	1441715	1441720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_013203	TAC	2	6	1441787	1441792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_013203	CGA	2	6	1443138	1443143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_013203	AAG	2	6	1443264	1443269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_013203	TAA	2	6	1444088	1444093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_013203	ATA	2	6	1444098	1444103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_013203	TCAA	2	8	1444125	1444132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_013203	GTT	2	6	1444155	1444160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_013203	T	6	6	1444165	1444170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_013203	TAT	2	6	1444239	1444244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_013203	T	6	6	1444269	1444274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_013203	AT	3	6	1444291	1444296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_013203	TAT	2	6	1444305	1444310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_013203	TGA	2	6	1444355	1444360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_013203	AGG	2	6	1444393	1444398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_013203	GCA	2	6	1445218	1445223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_013203	GGC	2	6	1445229	1445234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_013203	ATTT	2	8	1445265	1445272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_013203	GCT	2	6	1445300	1445305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_013203	TTA	2	6	1445316	1445321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_013203	TATC	2	8	1450111	1450118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_013203	AT	3	6	1450147	1450152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_013203	AAT	2	6	1453295	1453300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_013203	AAC	2	6	1453419	1453424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_013203	ATA	2	6	1453427	1453432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_013203	ATTAA	2	10	1453455	1453464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_013203	A	6	6	1453463	1453468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_013203	ATA	2	6	1453489	1453494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_013203	ATA	2	6	1453507	1453512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_013203	AAT	2	6	1453530	1453535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_013203	A	6	6	1453565	1453570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_013203	TTG	2	6	1453615	1453620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_013203	CAA	2	6	1453736	1453741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_013203	AAAGA	2	10	1453845	1453854	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_013203	AAC	2	6	1454038	1454043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_013203	GTCC	2	8	1454057	1454064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_013203	CCTC	2	8	1454092	1454099	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3045	NC_013203	ACG	2	6	1454141	1454146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_013203	GCC	2	6	1454336	1454341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_013203	AGG	2	6	1454474	1454479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_013203	GGT	2	6	1454561	1454566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_013203	ACG	2	6	1454630	1454635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_013203	GCC	2	6	1454831	1454836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_013203	GCT	2	6	1454857	1454862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_013203	AAC	2	6	1454874	1454879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_013203	CGT	2	6	1454922	1454927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_013203	CAG	2	6	1454938	1454943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_013203	ACCC	2	8	1455109	1455116	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3056	NC_013203	CTC	2	6	1455141	1455146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_013203	ACT	2	6	1455240	1455245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_013203	TCA	2	6	1455260	1455265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_013203	TGT	2	6	1455352	1455357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_013203	GCCTT	2	10	1455377	1455386	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3061	NC_013203	GGA	2	6	1455405	1455410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_013203	CGG	2	6	1455440	1455445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_013203	T	6	6	1455451	1455456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_013203	TC	3	6	1455462	1455467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_013203	ACC	2	6	1455549	1455554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_013203	CCG	2	6	1455571	1455576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_013203	GCT	2	6	1455659	1455664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_013203	GCGG	2	8	1455736	1455743	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3069	NC_013203	GA	3	6	1455917	1455922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_013203	ACTC	2	8	1456076	1456083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_013203	AG	3	6	1456295	1456300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_013203	C	6	6	1456322	1456327	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3073	NC_013203	AATG	2	8	1456466	1456473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_013203	TCGC	2	8	1456528	1456535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_013203	ACT	2	6	1456537	1456542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_013203	TA	3	6	1456617	1456622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_013203	CAG	2	6	1456625	1456630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_013203	TGG	2	6	1456652	1456657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_013203	CTT	2	6	1456740	1456745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_013203	TCT	2	6	1456777	1456782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_013203	ATA	2	6	1456816	1456821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_013203	TCT	2	6	1456846	1456851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_013203	GAA	2	6	1456853	1456858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_013203	TTTG	2	8	1456867	1456874	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_013203	CAA	2	6	1456942	1456947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_013203	ACT	2	6	1456971	1456976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_013203	A	6	6	1456981	1456986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_013203	TCT	2	6	1456999	1457004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_013203	AGG	2	6	1457026	1457031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_013203	C	6	6	1457077	1457082	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3091	NC_013203	ACCA	2	8	1457085	1457092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_013203	CCT	2	6	1457108	1457113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_013203	CGA	2	6	1457126	1457131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_013203	GTG	2	6	1457153	1457158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_013203	GT	3	6	1457168	1457173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_013203	GT	3	6	1457336	1457341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_013203	ATG	2	6	1457361	1457366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_013203	CGT	2	6	1457373	1457378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_013203	TCC	2	6	1457387	1457392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_013203	CGG	2	6	1457403	1457408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_013203	ACG	2	6	1457445	1457450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_013203	CACGA	2	10	1457487	1457496	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3103	NC_013203	GAC	2	6	1457500	1457505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_013203	CAC	2	6	1457513	1457518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_013203	ACG	2	6	1457540	1457545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_013203	CCG	2	6	1457549	1457554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_013203	TTC	2	6	1457584	1457589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_013203	GCT	2	6	1457619	1457624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_013203	GAA	2	6	1457711	1457716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_013203	CTC	2	6	1457797	1457802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_013203	GCC	2	6	1457825	1457830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_013203	TTC	2	6	1457844	1457849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_013203	GAGC	2	8	1457924	1457931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_013203	GCT	2	6	1458034	1458039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_013203	CTT	2	6	1458059	1458064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_013203	CTG	2	6	1458094	1458099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_013203	CTG	2	6	1458182	1458187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_013203	CTGG	2	8	1458225	1458232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_013203	TC	3	6	1458237	1458242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_013203	CAT	2	6	1458255	1458260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_013203	CAA	2	6	1458285	1458290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_013203	CCG	2	6	1458318	1458323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_013203	TAT	2	6	1458367	1458372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_013203	AC	3	6	1458446	1458451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_013203	GC	3	6	1458489	1458494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_013203	A	6	6	1458535	1458540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_013203	AGTTG	2	10	1458570	1458579	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_013203	TGTC	2	8	1458668	1458675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_013203	CGCTG	2	10	1458716	1458725	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3130	NC_013203	GTG	2	6	1458740	1458745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_013203	CGCGG	2	10	1458746	1458755	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3132	NC_013203	TCT	2	6	1458803	1458808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3264	NC_013203	CCG	2	6	1517635	1517640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3265	NC_013203	CAG	2	6	1517684	1517689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3266	NC_013203	CTTTT	2	10	1521524	1521533	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3267	NC_013203	ATTA	2	8	1521573	1521580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_013203	AAT	2	6	1521610	1521615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_013203	AAAAG	2	10	1524199	1524208	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_013203	TGG	2	6	1524246	1524251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_013203	TTC	2	6	1525649	1525654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3272	NC_013203	AT	3	6	1525707	1525712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_013203	CTT	2	6	1525748	1525753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3274	NC_013203	GAT	2	6	1525843	1525848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3275	NC_013203	T	6	6	1525913	1525918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3276	NC_013203	TTGC	2	8	1525928	1525935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3277	NC_013203	TCA	2	6	1525936	1525941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3278	NC_013203	T	6	6	1525966	1525971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3279	NC_013203	CTTT	2	8	1526012	1526019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3280	NC_013203	GAAA	2	8	1526020	1526027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3281	NC_013203	TC	3	6	1526330	1526335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3282	NC_013203	GCT	2	6	1526342	1526347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3283	NC_013203	ACA	2	6	1526353	1526358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3284	NC_013203	ATT	2	6	1526794	1526799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3285	NC_013203	CAA	2	6	1526831	1526836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3286	NC_013203	TAAAAC	2	12	1529182	1529193	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3287	NC_013203	AAG	2	6	1529195	1529200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3288	NC_013203	CTT	2	6	1529219	1529224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3289	NC_013203	TCT	2	6	1531199	1531204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3290	NC_013203	AT	3	6	1531215	1531220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3291	NC_013203	GTTG	2	8	1533368	1533375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3292	NC_013203	AGA	2	6	1533415	1533420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3293	NC_013203	GAA	2	6	1536396	1536401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3294	NC_013203	TTC	2	6	1536406	1536411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3295	NC_013203	TCT	2	6	1537467	1537472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3296	NC_013203	AGA	2	6	1537492	1537497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3297	NC_013203	ATA	2	6	1538664	1538669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3298	NC_013203	AAG	2	6	1538672	1538677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3299	NC_013203	CTT	2	6	1538694	1538699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3300	NC_013203	CGC	2	6	1538796	1538801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3302	NC_013203	AAAG	2	8	1538859	1538866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3303	NC_013203	T	6	6	1538868	1538873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3304	NC_013203	TCC	2	6	1540618	1540623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3306	NC_013203	CTT	2	6	1541457	1541462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3307	NC_013203	AAG	2	6	1541468	1541473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3308	NC_013203	A	7	7	1541483	1541489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3310	NC_013203	TTA	2	6	1541528	1541533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3311	NC_013203	GTC	2	6	1542126	1542131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3312	NC_013203	CAGT	2	8	1542135	1542142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3313	NC_013203	TCC	2	6	1542972	1542977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3315	NC_013203	TC	3	6	1543796	1543801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.